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三轮，小组赛参赛球队恢复为32支，均分成8组进行第一阶段小组赛，各小组前两名共16队进入第二阶段的小组赛，第三名进入欧洲联盟杯（欧洲足联欧洲联赛前身，下面简称：欧联）第三轮；第二阶段小组赛分为4组马来西亚足球网，各小组前两名共8支球队晋级淘汰赛。2003/04赛季起，取消第二阶段小组赛，第一阶段小组赛各小组两名共16队直接进行淘汰赛。2009/10赛季起，外围赛由3轮资格赛和1轮附加赛组成。2012/13赛季起

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比赛由南美洲足球联合会的10个成员国巴西、阿根廷、乌拉圭、巴拉圭、智利、哥伦比亚、厄瓜多尔、秘鲁、委内瑞拉、马来西亚足球网玻利维亚，再加上中北美州的墨西哥国内联赛球队参加，2005年之后参赛名额的分配为巴西和阿根廷各有5个，其它9个国家皆有3个，另外卫冕冠军不占用所在国家名额，他们将直接晋级32强小组赛。

比赛用球应为圆形，球的外壳应用皮革或其它许可的材料制成，由国际足球协会理事会随时决定制球马来西亚足球网的质料，任何经许可的质料，均应由国际足球理事会核准，在球的结构中不得使用可能伤害运动员的材料。